Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3443F7CCV5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm3443F7CCV5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3443F7CCV5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms