Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd50F7BE84 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd50F7BE84 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd50F7BE84 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd50F7BE84 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd50F7BE84 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms