Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm28048F7BCN0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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