Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms