Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms