Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms