Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms