Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnah11E9Q7N9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnah11E9Q7N9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms