Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtproE9Q612 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms