Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms