Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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