Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3095E9Q058 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms