Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms