Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brd1E9PZ26 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brd1E9PZ26 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brd1E9PZ26 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms