Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms