Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms