Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms