Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf217D3YYI7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf217D3YYI7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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