Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms