Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9230113P08RikD3YWX3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms