Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms