Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnyl1D3YUJ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnyl1D3YUJ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms