Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms