Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms