Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatipB9EKE5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms