Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms