Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrr3B2RXA8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms