Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms