Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms