Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Clrn2B2RVW2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms