Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm4787B2RUD9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm4787B2RUD9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm4787B2RUD9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm4787B2RUD9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm4787B2RUD9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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