Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms