Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms