Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms