Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms