Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms