Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms