Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Itga8A2ARA8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms