Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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Rtf1A2AQ19 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rtf1A2AQ19 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rtf1A2AQ19 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rtf1A2AQ19 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Rtf1A2AQ19 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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