Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms