Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camsap1A2AHC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Camsap1A2AHC3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms