Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms