Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms