Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myom3A2ABU4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myom3A2ABU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms