Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdc27A2A6Q5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms