Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calcoco2A2A6M5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms