Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms