Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf2A2A5Z6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf2A2A5Z6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms