Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms