Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms